Jede Untergruppe hat ihren eigenen Krankheitsverlauf und unterschiedliche Prognosen.
Ganz allgemein kann gesagt werden, dass es sich beim M.Still um die prognostisch schwerwiegendste Erkrankung handelt, weil neben den Gelenken auch innere Organe betroffen sind. Aber selbst beim M.Still besteht Aussicht auf eine Ausheilung der Erkrankung: so beruhigt sich die Krankheit bei ca. 15% der erkrankten Kinder nach einem, bei ca. 35% nach mehreren Schüben. Bei ca. der Hälfte der Kinder ist der Krankheitsverlauf aber chronisch und es kann teilweise zu schweren Gelenkschäden kommen.
Umgekehrt ist die Prognose bei Kindern mit oligoartikulären Arthritiden mit Beginn im frühen Kindesalter am besten. Die Krankheit kann bestenfalls ausheilen, manchmal kann sie sich aber auch auf weitere Gelenke ausdehnen. Da Augenentzündungen bei dieser Form in ca. 30% der Fälle auftreten, ist es wichtig, dass gerade diese Kinder - auch wenn die Arthritis zur Ruhe kommt - in regelmässiger augenärztlicher Kontrolle bleiben und bei Augenentzündungen konsequent behandelt werden, um bleibende Schäden am Auge zu vermeiden.